Protein–RNA interactions for Protein: Q14677

CLINT1, Clathrin interactor 1, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLINT1Q14677 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CLINT1Q14677 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms