Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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PMS2P11Q13670 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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