Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms