Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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