Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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CLN3Q13286 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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CLN3Q13286 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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CLN3Q13286 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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