Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.5 ms