Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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