Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms