Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms