Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BCAMP50895 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BCAMP50895 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BCAMP50895 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BCAMP50895 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BCAMP50895 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BCAMP50895 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BCAMP50895 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BCAMP50895 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BCAMP50895 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BCAMP50895 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BCAMP50895 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BCAMP50895 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BCAMP50895 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BCAMP50895 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BCAMP50895 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BCAMP50895 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
BCAMP50895 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BCAMP50895 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BCAMP50895 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BCAMP50895 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BCAMP50895 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BCAMP50895 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BCAMP50895 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BCAMP50895 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BCAMP50895 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BCAMP50895 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BCAMP50895 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BCAMP50895 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BCAMP50895 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BCAMP50895 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BCAMP50895 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
BCAMP50895 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BCAMP50895 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BCAMP50895 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BCAMP50895 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BCAMP50895 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BCAMP50895 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BCAMP50895 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BCAMP50895 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BCAMP50895 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BCAMP50895 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BCAMP50895 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BCAMP50895 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BCAMP50895 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BCAMP50895 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BCAMP50895 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BCAMP50895 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BCAMP50895 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BCAMP50895 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BCAMP50895 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BCAMP50895 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BCAMP50895 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BCAMP50895 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BCAMP50895 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BCAMP50895 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BCAMP50895 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BCAMP50895 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BCAMP50895 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BCAMP50895 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BCAMP50895 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BCAMP50895 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BCAMP50895 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BCAMP50895 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BCAMP50895 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BCAMP50895 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BCAMP50895 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BCAMP50895 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BCAMP50895 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BCAMP50895 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BCAMP50895 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BCAMP50895 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BCAMP50895 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BCAMP50895 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BCAMP50895 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BCAMP50895 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BCAMP50895 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BCAMP50895 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BCAMP50895 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BCAMP50895 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BCAMP50895 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BCAMP50895 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BCAMP50895 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BCAMP50895 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BCAMP50895 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BCAMP50895 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BCAMP50895 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BCAMP50895 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BCAMP50895 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BCAMP50895 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BCAMP50895 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BCAMP50895 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BCAMP50895 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BCAMP50895 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BCAMP50895 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BCAMP50895 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BCAMP50895 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BCAMP50895 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BCAMP50895 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BCAMP50895 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms