Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPFP49454 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPFP49454 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPFP49454 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPFP49454 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPFP49454 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPFP49454 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPFP49454 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPFP49454 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPFP49454 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPFP49454 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPFP49454 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPFP49454 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPFP49454 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPFP49454 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPFP49454 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPFP49454 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPFP49454 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPFP49454 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPFP49454 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPFP49454 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPFP49454 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPFP49454 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPFP49454 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPFP49454 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPFP49454 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPFP49454 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPFP49454 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPFP49454 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPFP49454 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPFP49454 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPFP49454 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPFP49454 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPFP49454 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPFP49454 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPFP49454 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPFP49454 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPFP49454 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPFP49454 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPFP49454 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPFP49454 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPFP49454 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPFP49454 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPFP49454 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms