Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms