Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ARL4AP40617 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ARL4AP40617 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ARL4AP40617 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
ARL4AP40617 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms