Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CTRLP40313 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
CTRLP40313 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CTRLP40313 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CTRLP40313 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CTRLP40313 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CTRLP40313 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CTRLP40313 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CTRLP40313 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CTRLP40313 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CTRLP40313 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
CTRLP40313 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
CTRLP40313 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CTRLP40313 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CTRLP40313 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CTRLP40313 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CTRLP40313 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CTRLP40313 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CTRLP40313 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CTRLP40313 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CTRLP40313 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
CTRLP40313 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CTRLP40313 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CTRLP40313 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CTRLP40313 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CTRLP40313 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CTRLP40313 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CTRLP40313 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CTRLP40313 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CTRLP40313 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CTRLP40313 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CTRLP40313 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CTRLP40313 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CTRLP40313 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CTRLP40313 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CTRLP40313 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CTRLP40313 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CTRLP40313 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CTRLP40313 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CTRLP40313 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms