Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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CASQ1P31415 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
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CASQ1P31415 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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CASQ1P31415 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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