Protein–RNA interactions for Protein: P23378

GLDC, Glycine dehydrogenase (decarboxylating), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLDCP23378 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLDCP23378 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLDCP23378 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLDCP23378 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLDCP23378 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLDCP23378 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLDCP23378 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLDCP23378 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLDCP23378 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLDCP23378 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLDCP23378 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLDCP23378 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLDCP23378 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLDCP23378 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLDCP23378 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLDCP23378 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLDCP23378 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLDCP23378 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLDCP23378 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLDCP23378 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLDCP23378 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GLDCP23378 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLDCP23378 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLDCP23378 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLDCP23378 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLDCP23378 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLDCP23378 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLDCP23378 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLDCP23378 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLDCP23378 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLDCP23378 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLDCP23378 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLDCP23378 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLDCP23378 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLDCP23378 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLDCP23378 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLDCP23378 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLDCP23378 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLDCP23378 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GLDCP23378 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GLDCP23378 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLDCP23378 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLDCP23378 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLDCP23378 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLDCP23378 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLDCP23378 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLDCP23378 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLDCP23378 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLDCP23378 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLDCP23378 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLDCP23378 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLDCP23378 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLDCP23378 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLDCP23378 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLDCP23378 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLDCP23378 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLDCP23378 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLDCP23378 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLDCP23378 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLDCP23378 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLDCP23378 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLDCP23378 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLDCP23378 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLDCP23378 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLDCP23378 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLDCP23378 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GLDCP23378 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLDCP23378 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLDCP23378 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLDCP23378 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLDCP23378 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLDCP23378 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLDCP23378 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLDCP23378 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLDCP23378 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GLDCP23378 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLDCP23378 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLDCP23378 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLDCP23378 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLDCP23378 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLDCP23378 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GLDCP23378 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLDCP23378 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLDCP23378 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLDCP23378 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLDCP23378 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLDCP23378 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLDCP23378 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLDCP23378 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLDCP23378 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLDCP23378 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLDCP23378 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLDCP23378 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLDCP23378 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLDCP23378 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLDCP23378 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLDCP23378 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLDCP23378 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLDCP23378 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLDCP23378 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms