Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1P21675 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1P21675 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1P21675 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1P21675 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1P21675 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1P21675 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1P21675 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1P21675 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1P21675 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1P21675 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1P21675 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1P21675 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1P21675 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1P21675 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1P21675 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1P21675 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1P21675 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1P21675 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1P21675 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1P21675 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1P21675 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1P21675 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1P21675 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1P21675 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1P21675 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1P21675 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1P21675 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1P21675 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1P21675 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1P21675 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1P21675 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1P21675 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1P21675 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1P21675 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1P21675 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1P21675 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1P21675 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1P21675 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1P21675 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1P21675 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1P21675 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1P21675 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1P21675 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1P21675 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1P21675 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1P21675 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1P21675 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1P21675 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1P21675 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1P21675 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1P21675 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1P21675 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1P21675 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1P21675 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1P21675 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1P21675 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF1P21675 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1P21675 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1P21675 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1P21675 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1P21675 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1P21675 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1P21675 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1P21675 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1P21675 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1P21675 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1P21675 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1P21675 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1P21675 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1P21675 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1P21675 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1P21675 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1P21675 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1P21675 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1P21675 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1P21675 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1P21675 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1P21675 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1P21675 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1P21675 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1P21675 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1P21675 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1P21675 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1P21675 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1P21675 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1P21675 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1P21675 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1P21675 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1P21675 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1P21675 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1P21675 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1P21675 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF1P21675 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TAF1P21675 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TAF1P21675 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF1P21675 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF1P21675 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF1P21675 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF1P21675 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms