Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms