Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms