Protein–RNA interactions for Protein: P12931

SRC, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Src, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCP12931 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRCP12931 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRCP12931 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRCP12931 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRCP12931 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRCP12931 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRCP12931 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRCP12931 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRCP12931 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRCP12931 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRCP12931 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRCP12931 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRCP12931 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRCP12931 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRCP12931 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRCP12931 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRCP12931 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRCP12931 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRCP12931 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRCP12931 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRCP12931 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRCP12931 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRCP12931 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRCP12931 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRCP12931 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRCP12931 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRCP12931 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRCP12931 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRCP12931 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRCP12931 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRCP12931 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRCP12931 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRCP12931 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRCP12931 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRCP12931 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRCP12931 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRCP12931 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRCP12931 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRCP12931 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRCP12931 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRCP12931 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRCP12931 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRCP12931 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRCP12931 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRCP12931 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRCP12931 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRCP12931 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRCP12931 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRCP12931 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms