Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms