Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms