Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
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