Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms