Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms