Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UTP11Q9Y3A2 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms