Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms