Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L6

FRMD4B, FERM domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4BQ9Y2L6 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FRMD4BQ9Y2L6 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms