Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms