Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms