Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms