Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms