Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

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Length 977 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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TRPC4Q9UBN4 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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TRPC4Q9UBN4 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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TRPC4Q9UBN4 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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TRPC4Q9UBN4 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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TRPC4Q9UBN4 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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TRPC4Q9UBN4 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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TRPC4Q9UBN4 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRPC4Q9UBN4 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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