Protein–RNA interactions for Protein: Q9P299

COPZ2, Coatomer subunit zeta-2, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ2Q9P299 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC13□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC13□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC13□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPZ2Q9P299 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.8 ms