Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRHQ9HD43 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms