Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFDQ9GZP0 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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