Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 ANKRD26-202ENST00000436985 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms