Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms