Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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USP43Q70EL4 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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USP43Q70EL4 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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USP43Q70EL4 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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USP43Q70EL4 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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USP43Q70EL4 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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USP43Q70EL4 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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