Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 UGT1A10-201ENST00000344644 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 MEIS2-206ENST00000424352 2917 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 PCDHGB8P-202ENST00000507007 2873 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 CWC25-202ENST00000614790 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 ZNF277-203ENST00000421043 2218 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms