Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms