Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms