Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms