Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP350Q5VT06 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP350Q5VT06 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP350Q5VT06 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP350Q5VT06 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP350Q5VT06 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP350Q5VT06 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP350Q5VT06 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP350Q5VT06 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP350Q5VT06 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP350Q5VT06 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP350Q5VT06 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP350Q5VT06 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP350Q5VT06 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP350Q5VT06 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP350Q5VT06 AC008555.6-201ENST00000605047 458 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP350Q5VT06 MIR6165-201ENST00000614803 84 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP350Q5VT06 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP350Q5VT06 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP350Q5VT06 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP350Q5VT06 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP350Q5VT06 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP350Q5VT06 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP350Q5VT06 ZNF684-201ENST00000372696 1009 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP350Q5VT06 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP350Q5VT06 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP350Q5VT06 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP350Q5VT06 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP350Q5VT06 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP350Q5VT06 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP350Q5VT06 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP350Q5VT06 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP350Q5VT06 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP350Q5VT06 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP350Q5VT06 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP350Q5VT06 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP350Q5VT06 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP350Q5VT06 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP350Q5VT06 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP350Q5VT06 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP350Q5VT06 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP350Q5VT06 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP350Q5VT06 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP350Q5VT06 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP350Q5VT06 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP350Q5VT06 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP350Q5VT06 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP350Q5VT06 PDLIM1P1-201ENST00000604187 969 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP350Q5VT06 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP350Q5VT06 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP350Q5VT06 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP350Q5VT06 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP350Q5VT06 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP350Q5VT06 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP350Q5VT06 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP350Q5VT06 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP350Q5VT06 AL162151.1-201ENST00000423922 561 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP350Q5VT06 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP350Q5VT06 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP350Q5VT06 SPC25-201ENST00000282074 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP350Q5VT06 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP350Q5VT06 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP350Q5VT06 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP350Q5VT06 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP350Q5VT06 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP350Q5VT06 TRIQK-219ENST00000523580 1630 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP350Q5VT06 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP350Q5VT06 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP350Q5VT06 SUGT1-202ENST00000343788 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP350Q5VT06 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP350Q5VT06 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP350Q5VT06 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP350Q5VT06 CIDEC-204ENST00000430427 877 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP350Q5VT06 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP350Q5VT06 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP350Q5VT06 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP350Q5VT06 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP350Q5VT06 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP350Q5VT06 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP350Q5VT06 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP350Q5VT06 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP350Q5VT06 TISP43-202ENST00000409982 1039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP350Q5VT06 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP350Q5VT06 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP350Q5VT06 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP350Q5VT06 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP350Q5VT06 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP350Q5VT06 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP350Q5VT06 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP350Q5VT06 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP350Q5VT06 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP350Q5VT06 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP350Q5VT06 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP350Q5VT06 GOSR2-231ENST00000640007 1425 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP350Q5VT06 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP350Q5VT06 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP350Q5VT06 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP350Q5VT06 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP350Q5VT06 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP350Q5VT06 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms