Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM56-201ENST00000370203 6822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 HK2P1-201ENST00000447818 2737 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 SP7-202ENST00000536324 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 DDX11-223ENST00000542838 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF130-207ENST00000522208 9945 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 FBXO9-202ENST00000323557 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 EPHB6-202ENST00000422643 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 POLR1B-201ENST00000263331 4558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 PES1-203ENST00000402281 2760 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 MADD-209ENST00000406482 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 MINK1-203ENST00000453408 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 HECTD4-202ENST00000377560 15759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 PCDHGA8-202ENST00000610569 6480 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 CAMK2B-209ENST00000395749 4447 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 NECTIN2-201ENST00000252483 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 PPP1R12B-214ENST00000491336 2046 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 ALS2CL-201ENST00000318962 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 FUBP1-202ENST00000370767 2524 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 CTCFL-217ENST00000608425 2915 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 PLEKHA6-202ENST00000414478 5091 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 ASB2-203ENST00000555019 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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COL5A1-AS1Q5SY13 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 ORAI2-210ENST00000611770 10679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 NBPF1-203ENST00000430580 5932 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 HMGB1-206ENST00000405805 4199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 HDGFL3-201ENST00000299633 12733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 NLRP7-206ENST00000588756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 VPS52-218ENST00000482399 3338 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 AL357054.4-201ENST00000606285 2814 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC00668-204ENST00000580197 2343 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 LRFN5-201ENST00000298119 3723 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 MYT1L-204ENST00000428368 4850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 MCM4-215ENST00000523944 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 CIT-203ENST00000392521 8708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 SPATS2L-205ENST00000409151 1979 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 TRAPPC2L-211ENST00000565504 3102 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 SMAD9-201ENST00000350148 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 STAT3-202ENST00000389272 2615 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 RBFOX1-208ENST00000547372 3524 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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