Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms