Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms