Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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