Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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