Protein–RNA interactions for Protein: Q16378

PRR4, Proline-rich protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR4Q16378 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 CMC2-201ENST00000219400 10301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 BRWD1-204ENST00000380800 7605 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 MBNL1-AS1-202ENST00000608395 6585 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 PDXK-201ENST00000291565 7366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 CCDC92-208ENST00000545135 4883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 SYNRG-229ENST00000621136 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRR4Q16378 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms